PocketDepth - A new depth based algortihm for identification of ligand binding sites
Upload a file in PDB format
Sample PDB
Paste a file in PDB format
Select from PDBbind dataset
deeper auto
Select from LigsiteCSC dataset 3tms._-1bid._ 8adh._-1cdo.A 1hxf.H-1dwd.H 2fbp.A-1fbp.A 1gcg._-1gca._ 1hel._-1hew._ 1npc._-1hyt._ 1esa._-1inc._ 1brq._-1rbp._ 8rat._-1rob._ 1swb.A-1stp._ 1ula._-1ulb._ 1ifb._-2ifb._ 3ptn._-3ptb._ 1ypi.A-2ypi.A 5dfr._-4dfr.A 3phv._-4phv.B 2ctv._-5cna.A 5cpa._-7cpa._ 1a6u.LH-1a6w.LH 1qif._-1acj._ 3app._-1apu._ 1djb._-1blh._ 1bya._-1byb._ 1cge._-1hfc._ 1hsi.AB-1ida.AB 1a4j.L-1igj.C 1ime.A-1imb.A 1nna._-1ivd._ 1ahc._-1mrg._ 2tga._-1mtw._ 4ca2._-1okm._ 1pdy._-1pdz._ 1phc._-1phd._ 1psn._-1pso._ 3lck._-1qpe._ 1bbs._-1rne._ 1stn._-1snc._ 1pts.AB-1srf.AB 2ctb._-2ctc._ 2cba._-2h4n._ 1krn._-2pk4._ 2sil._-2sim._ 1l3f._-2tmn._ 1chg.A-3gch.B 6ins.E-3mth.P 3p2p.AB-5p2p.AB 7rat._-6rsa._